Jw_cad作者さんのサイトの掲示板で以下の発言がありました
作者様にはいつもお世話になりありがとうございます。

皆様、ネストしたブロックについてお伺いします。

いくつかのブロック図形とその他の要素(文字・線分等)を纏めてブロック化した場合について、私の環境では作成元のブロック図形が表示のみレイヤにおいてもグレー表示にならない現象が出ています。

レイヤグループは表示のみの状態なのでそのブロックを選択できませんが、線色は表示されているので少し混乱します。

jwwのバージョンは7.11で、やむを得ない事情からwin7-32bitをwin10にしたPCで稼働させています。
動作環境的な問題かもしれませんし、そのような仕様である可能性もあると考えています。

過去ログではこのような状況の話題を発見できませんでした。
皆様の中で同様の現象がある方があればご教示いただけないでしょうか。

試しにやってみましたが
確かに
挙動が変な所がありますね。

元レイヤ優先しない・する、などコミコミで
簡単な図を ブロック化2重にして 
やってみましたが、表示のみと 非表示と 結果が違ったりしてる。同じように見えないとおかしいはずなのに、違ってしまってる。うん、こりゃ、何か変だw