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 名門進学校である翠陽学院高校の入学式の朝。最近よく見る夢のせいで遅刻しそうになった主人公(智哉)は、近道をして三人の不良に絡まれる。そこに現れた一人の美少女。智哉を助けたその少女は智哉と同じ学校の新入生だった。学年トップの成績にスポーツ万能の彼女は瞬く間に生徒達の憧れの的になる。多くの男子生徒が告白するも彼女は一顧だにしない。夏休みに学習会をしようと女子生徒が彼女を誘うと、彼女は智哉が参加するという条件で承諾する。次第に彼女を意識し始める智哉。そして夏休みが終わり新学期が始まる日の夜明け前、寝ている智哉の部屋に彼女が出現する……  ボーイミーツガールなSFファンタジー学園物語。