猛毒物質マイトトキシン(maitotoxin)の電子状態お茶の渋み成分、ガレート型カテキンの電子状態

2013年11月25日

脳内神経伝達物質エンドルフィンの電子状態

F01


幸せを感じるという脳内神経伝達物質のβ−エンドルフィン(Beta-endorphin)の電子状態(分子軌道)をDV-Xα法計算支援環境で計算してみました。


計算に用いた原子座標は、本間善夫先生、川端潤先生の「パソコンで見る動く分子事典(Windows Vista 対応版)」(講談社ブルーバックス, 2007年)の添付DVD-ROMに収録されていたものです。


分子量:3465.0

原子数:495

原子軌道数:986

サンプル点数:119,000 

総電子数:1,856

使用した原子基底関数:
 炭素原子:1s, 2s, 2p
 水素原子:1s
 窒素原子:1s, 2s, 2p
 酸素原子:1s, 2s, 2p
 硫黄原子:1s, 2s, 2p, 3s, 3p, 3d

以下に、β−エンドルフィン(Beta-endorphin)の最高被占軌道(HOMO, Highest Occupied Molecular Orbital)、最低空軌道(LUMO, Lowest Unoccupied Molecular Orbital)、静電ポテンシャルマップ(Electrostatic Potential Map, 等電子密度曲面に静電ポテンシャルの大小で彩色したもの)を示します。


HOMO


β−エンドルフィン(Beta-endorphin)のHOMO(928) エネルギー固有値:0.92202 eV


LUMO


β−エンドルフィン(Beta-endorphin)のLUMO(929) エネルギー固有値:3.63219 eV

HOMO-LUMO gap = 2.710 eV = 457.5 nm

POTMAP1


β−エンドルフィン(Beta-endorphin)の静電ポテンシャルマップ(Electrostatic Potential Map)


POTMAP5


β−エンドルフィン(Beta-endorphin)の静電ポテンシャルマップ(Electrostatic Potential Map)を回転させてみました。 


POTMAP9


β−エンドルフィン(Beta-endorphin)の静電ポテンシャルマップ(Electrostatic Potential Map)を、また違う方向から見たところ。


POTMAPl


β−エンドルフィン(Beta-endorphin)の静電ポテンシャルマップ(Electrostatic Potential Map)を、さらに回転させてみたところ。

図は VESTA Ver. 3.1.7 で描きました。


快楽物質エンドルフィン
ジョエル・デイビス
青土社
1997-06



エンドルフィン―脳がつくるアヘン
C.F. レヴィンソール
地人書館
1992-01







tgs0001 at 15:34│Comments(0)TrackBack(0)このエントリーをはてなブックマークに追加 mixiチェック Share on Tumblr Clip to Evernote 分子軌道 | 電子

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