肩こり・筋肉痛の薬、インドメタシンの電子状態抗生物質テラバンシン(telavancin, VIBATIV)の電子状態

2013年11月26日

アデノシン三リン酸(ATP)の電子状態

F01


生体のエネルギー通貨、アデノシン三リン酸(Adenosine triphosphate)の電子状態(分子軌道)をDV-Xα法計算支援環境で計算してみました。

参考:有機化学美術館「プリン体の話」

計算に用いた原子座標は、本間善夫先生、川端潤先生の「パソコンで見る動く分子事典(Windows Vista 対応版)」(講談社ブルーバックス, 2007年)の添付DVD-ROMに収録されていたものです。


アデノシン三リン酸:adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)

分子式:C10H16N5O13P3

分子量:507.18

CAS登録番号:56-65-5

原子数:47

原子軌道数:118

サンプル点数:981,400

総電子数:260

使用した原子基底関数:
 炭素(C)原子:1s, 2s, 2p
 水素(H)原子:1s
 窒素(N)原子:1s, 2s, 2p
 酸素(O)原子:1s, 2s, 2p
 リン(P)原子:1s, 2s, 2p, 3s, 3p, 3d

以下に、アデノシン三リン酸(Adenosine triphosphate)の最高被占軌道(HOMO, Highest Occupied Molecular Orbital)、最低空軌道(LUMO, Lowest Unoccupied Molecular Orbital)、静電ポテンシャルマップ(Electrostatic Potential Map, 等電子密度曲面に静電ポテンシャルの大小で彩色したもの)を示します。


HOMO


アデノシン三リン酸(Adenosine triphosphate)のHOMO(130) エネルギー固有値:0.13300 eV


LUMO


アデノシン三リン酸(Adenosine triphosphate)のLUMO(131) エネルギー固有値:3.44671 eV

HOMO-LUMO gap = 3.314 eV = 26726.9 cm-1 = 374.2 nm


tgs0001 at 18:36│Comments(0)TrackBack(0)このエントリーをはてなブックマークに追加 mixiチェック Share on Tumblr Clip to Evernote 分子軌道 | 電子

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